Búsqueda de Toxinas Afines a NaV1.7

Aplicación del farmacóforo funcional derivado de péptidos de veneno sobre la base de datos UniProt

Objetivo

Identificar toxinas peptídicas (reportadas y potenciales) con alta probabilidad de afinidad al canal de sodio NaV1.7, basándose en criterios estructurales y motivos funcionales validados experimentalmente.

Motivo de Búsqueda

El patrón X1X2–S–WCK–X3 identifica toxinas NaSpTx1 con capacidad inhibidora de el canal NaV1.7. Localizado en el bucle posterior al quinto residuo Cys del andamiaje ICK, combina: S (inicio del bucle), W (residuo aromático crítico para orientar el farmacóforo), C (parte del sistema de puentes disulfuro del ICK), K (contacto electrostático con E810/D815/E817 del canal), y X1-3 (residuos hidrofóbicos que estabilizan la conformación del bucle).

Este motivo permite filtrar en UniProt secuencias que conservan la arquitectura mínima necesaria para presentar afinidad funcional hacia NaV1.7.

Referencia Científica

Basado en el estudio publicado en FEBS Letters:

"Refining the NaV1.7 pharmacophore of a class of venom-derived peptide inhibitors via a combination of in silico screening and rational engineering" Ver artículo completo
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